MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 101901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012943	GGA	2	6	135912	135917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797029
3002	NC_012943	CAA	2	6	135999	136004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797029
3003	NC_012943	ATG	2	6	136452	136457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797030
3004	NC_012943	GCC	2	6	136485	136490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797030
3005	NC_012943	CTAC	2	8	136507	136514	25 %	25 %	0 %	50 %	253797030
3006	NC_012943	CGG	2	6	136651	136656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797030
3007	NC_012943	CCGG	2	8	136667	136674	0 %	0 %	50 %	50 %	253797030
3008	NC_012943	ACC	2	6	136686	136691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797030
3009	NC_012943	CGCA	2	8	136741	136748	25 %	0 %	25 %	50 %	253797030
3010	NC_012943	ATT	2	6	136752	136757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253797030
3011	NC_012943	TCG	2	6	136767	136772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797030
3012	NC_012943	TTG	2	6	136786	136791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797030
3013	NC_012943	GCG	2	6	136817	136822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797030
3014	NC_012943	GGC	2	6	136859	136864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797030
3015	NC_012943	CGT	2	6	136913	136918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797030
3016	NC_012943	CCG	2	6	136979	136984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797030
3017	NC_012943	TGATGC	2	12	137086	137097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253797030
3018	NC_012943	CTT	2	6	137226	137231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797030
3019	NC_012943	CGA	2	6	137240	137245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797030
3020	NC_012943	ATC	2	6	137250	137255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797030
3021	NC_012943	GCA	2	6	137266	137271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797030
3022	NC_012943	GGC	2	6	137276	137281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797030
3023	NC_012943	CAA	2	6	137295	137300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797030
3024	NC_012943	ATT	2	6	137338	137343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253797030
3025	NC_012943	CTG	2	6	137468	137473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797031
3026	NC_012943	TG	3	6	137600	137605	0 %	50 %	50 %	0 %	253797031
3027	NC_012943	GGT	2	6	137611	137616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797031
3028	NC_012943	TCG	2	6	137710	137715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797031
3029	NC_012943	GTT	2	6	137878	137883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797031
3030	NC_012943	CGG	2	6	137901	137906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797031
3031	NC_012943	TCA	2	6	138129	138134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797032
3032	NC_012943	TACG	2	8	138155	138162	25 %	25 %	25 %	25 %	253797032
3033	NC_012943	GGC	2	6	138168	138173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797032
3034	NC_012943	GCG	2	6	138194	138199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797032
3035	NC_012943	GAA	2	6	138208	138213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797032
3036	NC_012943	CAG	2	6	138254	138259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797032
3037	NC_012943	TGA	2	6	138276	138281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797032
3038	NC_012943	CAC	2	6	138371	138376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797032
3039	NC_012943	GAC	2	6	138435	138440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797032
3040	NC_012943	CA	3	6	138504	138509	50 %	0 %	0 %	50 %	253797032
3041	NC_012943	CGC	2	6	138514	138519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797032
3042	NC_012943	TGC	2	6	138520	138525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797032
3043	NC_012943	G	6	6	138630	138635	0 %	0 %	100 %	0 %	253797032
3044	NC_012943	CGG	2	6	138687	138692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797033
3045	NC_012943	GAGAT	2	10	138794	138803	40 %	20 %	40 %	0 %	253797033
3046	NC_012943	TCGC	2	8	138810	138817	0 %	25 %	25 %	50 %	253797033
3047	NC_012943	TCGA	2	8	138844	138851	25 %	25 %	25 %	25 %	253797033
3048	NC_012943	TC	3	6	138862	138867	0 %	50 %	0 %	50 %	253797033
3049	NC_012943	GAA	2	6	138868	138873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797033
3050	NC_012943	CGG	2	6	138901	138906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797033
3051	NC_012943	GGT	2	6	138925	138930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797033
3052	NC_012943	CTC	2	6	138968	138973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797033
3053	NC_012943	TCG	2	6	138991	138996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797033
3054	NC_012943	TGG	3	9	139004	139012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797033
3055	NC_012943	TCG	2	6	139045	139050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797033
3056	NC_012943	GGT	2	6	139114	139119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797033
3057	NC_012943	CGC	2	6	139134	139139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797033
3058	NC_012943	CGG	2	6	139146	139151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797033
3059	NC_012943	GTG	2	6	139189	139194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797033
3060	NC_012943	CGG	2	6	139210	139215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797033
3061	NC_012943	CTT	2	6	139243	139248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797033
3062	NC_012943	CGG	2	6	139257	139262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797033
3063	NC_012943	GTC	2	6	139275	139280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797033
3064	NC_012943	CAA	2	6	139297	139302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797033
3065	NC_012943	GTC	2	6	139309	139314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797033
3066	NC_012943	GACGCG	2	12	139321	139332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253797033
3067	NC_012943	CACT	2	8	139341	139348	25 %	25 %	0 %	50 %	253797033
3068	NC_012943	TCT	2	6	139380	139385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797033
3069	NC_012943	GTG	2	6	139387	139392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797033
3070	NC_012943	ATG	2	6	139558	139563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797033
3071	NC_012943	CGCA	2	8	139593	139600	25 %	0 %	25 %	50 %	253797033
3072	NC_012943	GGA	2	6	139618	139623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797033
3073	NC_012943	TG	3	6	139751	139756	0 %	50 %	50 %	0 %	253797033
3074	NC_012943	CGA	2	6	139772	139777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797033
3075	NC_012943	ACC	2	6	140407	140412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797034
3076	NC_012943	GACC	2	8	140514	140521	25 %	0 %	25 %	50 %	253797034
3077	NC_012943	CGC	2	6	140543	140548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797034
3078	NC_012943	GGC	2	6	140684	140689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797034
3079	NC_012943	ACG	2	6	140702	140707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797034
3080	NC_012943	GGA	2	6	140720	140725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797034
3081	NC_012943	CTG	2	6	140737	140742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797034
3082	NC_012943	CACC	2	8	140822	140829	25 %	0 %	0 %	75 %	253797034
3083	NC_012943	CACC	2	8	140865	140872	25 %	0 %	0 %	75 %	253797034
3084	NC_012943	CGGCG	2	10	140948	140957	0 %	0 %	60 %	40 %	253797034
3085	NC_012943	GTG	2	6	140971	140976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797034
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3087	NC_012943	CAC	2	6	141006	141011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797034
3088	NC_012943	CGG	2	6	141071	141076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797034
3089	NC_012943	CTGA	2	8	141085	141092	25 %	25 %	25 %	25 %	253797034
3090	NC_012943	GATA	2	8	141130	141137	50 %	25 %	25 %	0 %	253797034
3091	NC_012943	TCG	2	6	141358	141363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797035
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3093	NC_012943	TGCGG	2	10	141581	141590	0 %	20 %	60 %	20 %	253797035
3094	NC_012943	ACG	2	6	141639	141644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797035
3095	NC_012943	GGCT	2	8	141709	141716	0 %	25 %	50 %	25 %	253797035
3096	NC_012943	TGA	2	6	141791	141796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797035
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3099	NC_012943	CGG	2	6	141844	141849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797035
3100	NC_012943	TGC	2	6	141853	141858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797035
3101	NC_012943	CGC	2	6	141950	141955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797035
3102	NC_012943	GTG	2	6	142099	142104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797035
3103	NC_012943	CG	3	6	142110	142115	0 %	0 %	50 %	50 %	253797035
3104	NC_012943	GC	3	6	142210	142215	0 %	0 %	50 %	50 %	253797035
3105	NC_012943	GGCGCT	2	12	142217	142228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797035
3106	NC_012943	CGC	2	6	142269	142274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797035
3107	NC_012943	CGCTG	2	10	142288	142297	0 %	20 %	40 %	40 %	253797036
3108	NC_012943	GCC	2	6	142441	142446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797036
3109	NC_012943	GGC	2	6	142522	142527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797036
3110	NC_012943	TCG	2	6	142547	142552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797036
3111	NC_012943	CGC	2	6	142563	142568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797036
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3116	NC_012943	GTTGC	2	10	142834	142843	0 %	40 %	40 %	20 %	253797036
3117	NC_012943	GAT	3	9	142887	142895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797036
3118	NC_012943	CCG	2	6	142906	142911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797036
3119	NC_012943	CGC	2	6	142963	142968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797036
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3363	NC_012943	TGC	2	6	151847	151852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797044
3364	NC_012943	CGG	2	6	151880	151885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797044
3365	NC_012943	GGC	2	6	151894	151899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797044
3366	NC_012943	CGT	2	6	151917	151922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797044
3367	NC_012943	GGT	2	6	151977	151982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797044
3368	NC_012943	CGGG	2	8	152084	152091	0 %	0 %	75 %	25 %	253797044
3369	NC_012943	CGT	2	6	152094	152099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797044
3370	NC_012943	GGT	2	6	152115	152120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797044
3371	NC_012943	GGCGAT	2	12	152196	152207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253797044
3372	NC_012943	G	6	6	152230	152235	0 %	0 %	100 %	0 %	253797044
3373	NC_012943	CACC	2	8	152237	152244	25 %	0 %	0 %	75 %	253797044
3374	NC_012943	ACA	2	6	152288	152293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797044
3375	NC_012943	CGG	2	6	152336	152341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797044
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3381	NC_012943	TTC	2	6	152806	152811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797045
3382	NC_012943	ATCG	2	8	152851	152858	25 %	25 %	25 %	25 %	253797045
3383	NC_012943	GCC	2	6	152901	152906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797045
3384	NC_012943	CGC	2	6	152918	152923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797045
3385	NC_012943	CGG	2	6	152931	152936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797045
3386	NC_012943	TGC	2	6	152963	152968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797045
3387	NC_012943	CGA	2	6	152985	152990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797045
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3390	NC_012943	CAT	2	6	153033	153038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797045
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3392	NC_012943	CGC	2	6	153094	153099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797045
3393	NC_012943	AGCG	2	8	153145	153152	25 %	0 %	50 %	25 %	253797045
3394	NC_012943	ATC	2	6	153169	153174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797045
3395	NC_012943	TCG	2	6	153176	153181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797045
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3452	NC_012943	CGCC	2	8	155839	155846	0 %	0 %	25 %	75 %	253797046
3453	NC_012943	GA	3	6	155935	155940	50 %	0 %	50 %	0 %	253797047
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3472	NC_012943	TCGCGG	2	12	156529	156540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797047
3473	NC_012943	TACC	2	8	156569	156576	25 %	25 %	0 %	50 %	253797047
3474	NC_012943	TCAA	2	8	156601	156608	50 %	25 %	0 %	25 %	253797047
3475	NC_012943	AGGCG	2	10	156648	156657	20 %	0 %	60 %	20 %	253797047
3476	NC_012943	GGC	2	6	156842	156847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797048
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3480	NC_012943	GT	3	6	156944	156949	0 %	50 %	50 %	0 %	253797048
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3482	NC_012943	TGT	2	6	157060	157065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797048
3483	NC_012943	CGC	2	6	157066	157071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797048
3484	NC_012943	GTT	2	6	157118	157123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797048
3485	NC_012943	GGAC	2	8	157181	157188	25 %	0 %	50 %	25 %	253797048
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3487	NC_012943	ACG	2	6	157285	157290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797048
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